【iRepertoire】iRepertoire reagent
免疫組庫分析樣品製備試劑

產品敘述
專為免疫組庫定序設計的多重PCR解決方案
T/B細胞扮演著重要的免疫辨識、反應的關鍵角色，偵測體內T/B細胞，可即時監控身體的免疫狀況。過去分析T/B細胞中可能具有的上千萬種免疫組庫(immune repertoire)相當困難，但現在利用multiplex PCR，配合高通量定序(high throughput sequencing)，可以針對T/B細胞受器的所有組合型態、強度及多樣性進行分析。
  • 採用專利multiplex PCR (arm-PCR)，解決傳統多重PCR常見在不同primer組增幅效率不同、目標片段擴增條件需求不同，背景訊號干擾，以及primer聚合體問題。
  • 新型Dimer avoided multiplex PCR (dam-PCR) 技術，在PCR進行前移除未完整的副產物及primer，減少增幅偏差，並且將UMI添加於mRNA上以解決PCR及定序上的錯誤和提高特異性。


利用矩形式樹狀結構圖（Treemap）呈現免疫組庫多樣性，不同色塊的矩形代表不同V-J-CDR3的組合，矩形面積大小代表該組合相對的表現頻率。

免疫組庫樣本製備套組
 
產品名稱 iR-Profile kits Bulk Primer kits iR-Flex automation system
使用技術 arm-PCR arm-PCR arm-PCR/dam-PCR
優點
  • 各種鏈可任意組合
  • 包含所有建立免疫組庫library必須試劑
  • 適合有大量上機需求，更經濟的選擇
  • 從樣本RNA到免疫組庫library建立全自動化系統，可有效地降低人為操作誤差
  • 單次使用的密閉卡匣，可避免樣品汙染
  • 最多可串聯4個iR-Processor模組，有效地增加實驗室檢驗效率
操作方式 手動 手動 自動

單細胞定序服務 iPair
淋巴球受體(TCR/BCR) 通常為異二聚體(heterodimer，如TCR a/b、TCR d/r或 IgH/(k l) )，大部分免疫組庫定序只針對免疫細胞受體中的其中一條鍊進行定序，iPair可以提供單細胞中兩條鏈的配對組合定序以及分析方案。

iPair+
  • Gene-specific panel : 以iPair為基礎再增加30個免疫細胞相關的表面標誌(surface markers)，細胞激素(cytokines)以及轉錄因子(transcription factors)基因表現分析。
  • oligo-dt : 加入獨特分子標記(UMI)標記每個細胞，增加100個免疫細胞相關表面標誌，並可控制讀取深度。
產品特色
iR-Profile kits & Bulk Primer kits
  • 操作簡便 : 樣本需求量低，最低僅需10 ng 高品質RNA即可進行樣品製備。
  • 應用範圍廣泛：包含人類、小鼠的TCR 的α、β、δ、γ四種鏈以及BCR的 IgH 和Igκ, Igλ三種等共計七種鏈均可以進行定序和分析。
  • 分析多種樣品來源：包含來自於周邊血、分選細胞或是組織中淋巴球的RNA樣本。此外在TCR β 鏈還提供gDNA定序方案。
  • 定序覆蓋範圍廣：可全面覆蓋V(D)J區域，包含所有的互補決定區域(Complementarity determining regions，CDRs ) CDR1, CDR2, CDR3。
  • 多重樣本可同時上機：最多提供高達60組上機條碼，實現單通道多樣本定序，以降低上機成本。
  • 適用於illumina定序平台：可使用MiSeq平台進行定序。
  • 可靈活組合產品：客製化現有鏈組合，增加實驗設計上的彈性。
  • 可透過線上工具分析定序數據結果 : 包括IMGT比對結果、CDR3種類、數量、長度，多胜肽序列、V & J gene 使用頻率以及多種變異指數，可以免除惱人的生物資訊軟體設定及操作。

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