【Cantata Bio】Dovetail® HiChIP MNase Kit

產品敘述
Dovetail™ HiChIP kit結合了Micro-C和ChIP-seq 技術，使用微球菌核酸酶(micrococcal nuclease, MNase)取代傳統Hi-C技術中的限制性內切酶，提供核小體層級的高解析度Hi-C數據，並透過抗體連結特定核酸結合蛋白進行染色質免疫沉澱(ChIP)，使研究者能夠測定蛋白質對染色質結構或基因表達的影響。

Dovetail™ HiChIP kit可搭配各種研究者感興趣之DNA結合蛋白抗體，也可參照Dovetail已驗證過的抗體清單進行實驗，包含CTCF、H3K4ac、H3K4me3、H3K14ac等。

Dovetail™ HiChIP MNase Kit | Validated Antibodies
CELL INPUT AMOUNT DOVETAIL™ HICHIP VALIDATED ANTIBODY SUPPLIER PART NUMBER
1 M IgG Cell Signaling 2729
1 M CTCF Cell Signaling 3418
1 M H3K4ac Active Motif 39381
1 M H3K4me3 Cell Signaling 9751
1 M H3K14ac Cell Signaling 7627
1 M CH3K27ac Cell Signaling 8173
1 M H3K27me3 Cell Signaling 9733
1 M H3K36me3 Cell Signaling 4909
1 M SMC3 Abcam ab9263
5 M Oct4 Cell Signaling 2890
5 M Sox2 Cell Signaling 23064
5 M Klf4 Abcam ab106629
5 M Nanog Abcam ab21624
5 M PolII Active Motif 61667

應用領域 :
  • 蛋白質對染色質結構分析
  • 研究基因之間的調控機制
  • 探索新的增強子(enhancer)或超級增強子(super-enhancer)
產品特色
  • 可同時獲得ChIP-seq以及Hi-C資訊
  • 提供多種已驗證抗體資訊，可直接搭配使用
  • 以核小體層級的解析度探討染色質間的相互作用
工作原理
  1. 以甲醛及DSG固定細胞核內染色質
  2. 在相鄰的染色質間產生鍵結 (crosslinking)，
  3. 使用MNase將DNA切成小片段
  4. 進行染色質免疫沉澱(ChIP)
  5. 接續鄰位接合(proximity ligation)，將空間中鄰近的DNA片段接合建立帶有生物素標記的寡核苷酸橋(biotinylated oligonucleotide bridge)。
  6. 再將鍵結還原 (reverse cross-linking)，打開相鄰分子間的鍵結，使接合的分子恢復為線狀。
  7. 純化帶有生物素標定的DNA序列並製備定序文庫，後續使用定序儀進行雙端定序。
產品規格

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